三个月的婴儿早上咳嗽，可能是正常的生理现象，也可能与疾病有关。以下是一些可能的原因：
-环境刺激：早上空气中的灰尘、花粉等可能刺激婴儿的呼吸道，引起咳嗽。
-体位改变：婴儿从睡眠中醒来，体位发生改变，可能导致呼吸道分泌物流动，刺激咳嗽反射。
-呼吸道感染：如感冒、肺炎等，可导致咳嗽、流涕、发热等症状。
-过敏：婴儿可能对空气中的过敏原过敏，如尘螨、花粉等，引起咳嗽、打喷嚏等症状。
如果婴儿早上咳嗽持续时间较长、伴有其他症状或咳嗽逐渐加重，建议及时就医，进行详细的检查和诊断，以确定具体原因并采取相应的治疗措施。
